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恒达田誌新教授課題組開發出新方法應用於癌症標誌物篩查

來源⬜️:化學科學與工程學院   時間:2019-06-17  瀏覽:

蛋白質N-糖基化的異常表達與癌症的發生發展密切相關👮,癌症及癌症幹細胞差異表達N-糖基化的研究是發現癌症診斷和預後標誌物、了解癌症發生發展分子機製、藥物靶點發現‼️、藥物開發與評價等研究方向上的重點研究內容。基於質譜的N-糖蛋白質組學目前已廣泛應用於疾病相關N-糖基化的研究🎴,在N-連接糖單糖組成層次上實現了位點特異的高通量定性定量分析🚲;然而,N-糖基化的功能與其拓撲結構一一對應,結構特異性表征急需發展。

恒达平台化學科學與工程學院田誌新教授課題組長期致力於癌症及癌症幹細胞潛在N-糖蛋白標誌物發現領域的研究🚁。該課題組基於前期研發的蛋白質質譜原位解析算法“同位素輪廓指紋比對”、完整蛋白質數據庫搜索引擎ProteinGoggle💟🧚🏿‍♀️、磷酸化修飾準確定位工具P-bracket等工作👨‍🚀,研發了完整的N-糖肽數據庫搜索引擎GPSeeker🔉;基於結構特征離子,GPSeeker實現了完整N-糖肽水平上的N-糖基化的結構特異性鑒定;同時,發展了RPLC-HILIC結構特異的二維高效液相色譜分離。二者的結合實現了肝癌(HepG2細胞相對於正常肝臟LO2細胞)完整N-糖肽水平上的潛在N-糖基化標誌物的位點和結構特異性鑒定🟠;觀察到了唾液酸鏈接異構和巖藻糖序列異構在癌症條件下的不同差異表達💉。該研究成果近期已經在線發表於知名國際期刊《Journal of Proteome Research》(論文鏈接🧗🏿:https://pubs.acs.org/doi/10.1021/acs.jproteome.9b00191)上。課題組博士研究生肖開捷為論文第一作者♑️,田誌新教授為通訊作者。

 

上述研究論文在線發表後,Wiley旗下現代實驗室操作指南系列之一《Current Protocols in Protein Science》 一位編輯Mohamed Abdel-Mohsen教授對上述工作給予了高度評價🤔:“very interesting and could have many applications in the glycoimmunology field…a written protocol of how to use this tool could be very useful to the field…this novel tool will be very valuable to the glycobiology/glycoimmunology field”,並邀請課題組撰寫一篇操作指南應用於糖生物學及糖免疫學等領域有關研究🤵‍♀️。 

基於上述新開發的方法💇🏿,課題組對乳腺癌癌症幹細胞進行了研究👨🏻‍✈️🚴🏻‍♀️,在完整N-糖肽水平上實現了潛在N-糖基化標誌物的位點和結構特異的組學高通量鑒定。相關研究成果已於近日在線發表在國際知名化學期刊《Chemical Communications》上(論文鏈接🏋🏼‍♀️:https://doi.org/10.1039/C9CC04114A)🎋。課題組博士王悅為該論文的共同第一作者🦁,田誌新教授為共同通訊作者。該研究得到了南京醫科大學陳芸教授課題組合作。

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